公司坚持“品质创造价值，创新成就未来”的经营理念，以 “科技兴企”为发展宗旨，以为股东、客户、企业、员工及社会创造价值为已任，在科研上不断创新，为广大患者提供优质、安全的药品，为人类的健康事业做出贡献。
公司将以“亚字”、“三花”和“四星”三大品牌为基石，同时重点发展心血管类、抗肿瘤类、消化道类和外用药类等多个系列的药品，为抗感染药及其它相应领域的治疗做出应有的贡献。
展望未来，在上药集团建设产业园区、重组新上药的大背景下，公司将遵循新上药发展原则，结合新上药发展战略，以上海新亚药业有限公司为主体平台，整合抗生素业务板块中的医药优质资产，使其成为法人治理结构明晰、经营主业合理、企业竞争力强、符合上市公司要求的法人实体，发展成为新上药的核心企业。
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